MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Shewanella baltica OS117 chromosome

Total Repeats: 75857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017579	ACG	3	9	31	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338937
2	NC_017579	GCC	2	6	55	60	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386338937
3	NC_017579	ATG	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338937
4	NC_017579	CAA	2	6	603	608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338938
5	NC_017579	CAG	2	6	642	647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338938
6	NC_017579	ATGG	2	8	681	688	25 %	25 %	50 %	0 %	386338938
7	NC_017579	GTC	2	6	823	828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338938
8	NC_017579	ACG	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338938
9	NC_017579	AGCCG	2	10	926	935	20 %	0 %	40 %	40 %	386338938
10	NC_017579	GCG	2	6	1026	1031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386338938
11	NC_017579	GGT	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338938
12	NC_017579	ATT	2	6	1070	1075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386338938
13	NC_017579	TTG	2	6	1110	1115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338938
14	NC_017579	AAT	2	6	1143	1148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338938
15	NC_017579	GAA	2	6	1227	1232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338938
16	NC_017579	TAC	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338938
17	NC_017579	GAT	2	6	1272	1277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338938
18	NC_017579	T	6	6	1284	1289	0 %	100 %	0 %	0 %	386338938
19	NC_017579	AAG	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338938
20	NC_017579	CTTG	2	8	1337	1344	0 %	50 %	25 %	25 %	386338938
21	NC_017579	ATT	2	6	1359	1364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386338938
22	NC_017579	TTGG	2	8	1426	1433	0 %	50 %	50 %	0 %	386338938
23	NC_017579	CCA	2	6	1455	1460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386338938
24	NC_017579	CTT	2	6	1535	1540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338938
25	NC_017579	CGTG	2	8	1565	1572	0 %	25 %	50 %	25 %	386338938
26	NC_017579	GCC	2	6	1621	1626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386338938
27	NC_017579	TAC	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338938
28	NC_017579	TGT	2	6	1750	1755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338938
29	NC_017579	TAAC	2	8	1819	1826	50 %	25 %	0 %	25 %	386338938
30	NC_017579	TGG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338938
31	NC_017579	CAC	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386338938
32	NC_017579	AG	3	6	1916	1921	50 %	0 %	50 %	0 %	386338938
33	NC_017579	AGA	2	6	1934	1939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338938
34	NC_017579	TCT	2	6	1965	1970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338938
35	NC_017579	GT	3	6	2041	2046	0 %	50 %	50 %	0 %	386338939
36	NC_017579	CCT	2	6	2088	2093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386338939
37	NC_017579	AAGT	2	8	2099	2106	50 %	25 %	25 %	0 %	386338939
38	NC_017579	TCAC	2	8	2109	2116	25 %	25 %	0 %	50 %	386338939
39	NC_017579	GAA	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338939
40	NC_017579	TAC	2	6	2193	2198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338939
41	NC_017579	GCT	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338939
42	NC_017579	AAC	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338939
43	NC_017579	ATA	2	6	2273	2278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338939
44	NC_017579	TGC	2	6	2285	2290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338939
45	NC_017579	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338939
46	NC_017579	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386338939
47	NC_017579	GC	3	6	2493	2498	0 %	0 %	50 %	50 %	386338939
48	NC_017579	CGAC	2	8	2504	2511	25 %	0 %	25 %	50 %	386338939
49	NC_017579	CTA	2	6	2666	2671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338939
50	NC_017579	AAGC	2	8	2782	2789	50 %	0 %	25 %	25 %	386338939
51	NC_017579	CGAA	2	8	2813	2820	50 %	0 %	25 %	25 %	386338939
52	NC_017579	GTG	2	6	2828	2833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338939
53	NC_017579	GAA	2	6	2890	2895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338939
54	NC_017579	ATC	2	6	2905	2910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338939
55	NC_017579	CAA	2	6	2976	2981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338939
56	NC_017579	GAT	2	6	2992	2997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338939
57	NC_017579	GAA	2	6	3052	3057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338939
58	NC_017579	ATGT	2	8	3064	3071	25 %	50 %	25 %	0 %	386338939
59	NC_017579	ATTT	2	8	3421	3428	25 %	75 %	0 %	0 %	386338940
60	NC_017579	CGTT	2	8	3442	3449	0 %	50 %	25 %	25 %	386338940
61	NC_017579	TAA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338940
62	NC_017579	CGA	3	9	3483	3491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338940
63	NC_017579	GC	3	6	3523	3528	0 %	0 %	50 %	50 %	386338940
64	NC_017579	GTG	2	6	3563	3568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338940
65	NC_017579	TCG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338940
66	NC_017579	CG	3	6	3956	3961	0 %	0 %	50 %	50 %	386338940
67	NC_017579	ACT	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338940
68	NC_017579	ATT	2	6	4119	4124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386338940
69	NC_017579	ACA	2	6	4164	4169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338940
70	NC_017579	GAT	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338940
71	NC_017579	TCCG	2	8	4206	4213	0 %	25 %	25 %	50 %	386338940
72	NC_017579	CTG	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338940
73	NC_017579	AC	3	6	4317	4322	50 %	0 %	0 %	50 %	386338940
74	NC_017579	ATA	2	6	4389	4394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338941
75	NC_017579	TTC	2	6	4414	4419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338941
76	NC_017579	CGA	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
77	NC_017579	CAT	2	6	4505	4510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338941
78	NC_017579	AGT	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338941
79	NC_017579	GAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338941
80	NC_017579	GCA	2	6	4664	4669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
81	NC_017579	CGG	2	6	4696	4701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386338941
82	NC_017579	CGA	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
83	NC_017579	TCG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
84	NC_017579	TGAT	2	8	5007	5014	25 %	50 %	25 %	0 %	386338941
85	NC_017579	ACA	2	6	5022	5027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338941
86	NC_017579	GAAT	2	8	5029	5036	50 %	25 %	25 %	0 %	386338941
87	NC_017579	ATT	2	6	5073	5078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386338941
88	NC_017579	TAA	2	6	5086	5091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338941
89	NC_017579	CAA	2	6	5101	5106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338941
90	NC_017579	CAA	2	6	5206	5211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338941
91	NC_017579	TGG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338941
92	NC_017579	CGA	2	6	5332	5337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
93	NC_017579	AGTGA	2	10	5423	5432	40 %	20 %	40 %	0 %	386338941
94	NC_017579	CTG	2	6	5477	5482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
95	NC_017579	GCG	2	6	5546	5551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386338941
96	NC_017579	CGT	2	6	5573	5578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
97	NC_017579	GGT	2	6	5597	5602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338941
98	NC_017579	CTG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
99	NC_017579	TGT	2	6	5778	5783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338941
100	NC_017579	AAG	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338941
101	NC_017579	CGA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
102	NC_017579	CAT	4	12	5872	5883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338941
103	NC_017579	CTT	3	9	5932	5940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338941
104	NC_017579	ATTG	2	8	5956	5963	25 %	50 %	25 %	0 %	386338941
105	NC_017579	CCA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386338941
106	NC_017579	GCAA	2	8	6015	6022	50 %	0 %	25 %	25 %	386338941
107	NC_017579	ACCCA	2	10	6096	6105	40 %	0 %	0 %	60 %	386338941
108	NC_017579	TTG	2	6	6174	6179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338941
109	NC_017579	AGC	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
110	NC_017579	ACC	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386338941
111	NC_017579	TGG	2	6	6306	6311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386338941
112	NC_017579	AGC	2	6	6320	6325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338941
113	NC_017579	CTG	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
114	NC_017579	CTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338941
115	NC_017579	GCG	2	6	6479	6484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386338941
116	NC_017579	GAA	2	6	6500	6505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338941
117	NC_017579	GGC	2	6	6506	6511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386338941
118	NC_017579	AAG	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386338941
119	NC_017579	CGT	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
120	NC_017579	TGA	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338941
121	NC_017579	GTT	2	6	6721	6726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338941
122	NC_017579	TCG	2	6	6757	6762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338941
123	NC_017579	TCT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386338942
124	NC_017579	CAA	2	6	6926	6931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338942
125	NC_017579	TGC	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338942
126	NC_017579	ACA	2	6	7051	7056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386338942
127	NC_017579	CAT	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338942
128	NC_017579	CG	3	6	7209	7214	0 %	0 %	50 %	50 %	386338942
129	NC_017579	GCA	2	6	7460	7465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338942
130	NC_017579	AGT	2	6	7529	7534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338942
131	NC_017579	TTGT	2	8	7559	7566	0 %	75 %	25 %	0 %	386338942
132	NC_017579	TAA	2	6	7874	7879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386338943
133	NC_017579	AGC	2	6	7978	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338943
134	NC_017579	TTG	2	6	8040	8045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386338943
135	NC_017579	GCA	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386338943
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137	NC_017579	TCG	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338944
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141	NC_017579	CTG	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338944
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158	NC_017579	GTC	2	6	9313	9318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338944
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169	NC_017579	T	6	6	10555	10560	0 %	100 %	0 %	0 %	386338947
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252	NC_017579	TGA	2	6	15839	15844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386338951
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260	NC_017579	TGATG	2	10	16233	16242	20 %	40 %	40 %	0 %	386338951
261	NC_017579	CAT	2	6	19918	19923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338952
262	NC_017579	ACC	2	6	19943	19948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386338952
263	NC_017579	ATC	2	6	20090	20095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386338952
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265	NC_017579	GTC	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386338952
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